根據《中央生態環境保護督察工作規定》，中央第六生態環境保護督察組（以下簡稱督察組）對湖南省開展了第二輪生態環境保護督察。2021年5月28日，中央生態環境保護督察工作領導小組第三次會議審議通過督察報告。經黨中央、國務院批準，督察組于2021年7月16日向湖南省委、省政府進行反饋。
湖南省高度重視此次督察工作，邊督邊改、立行立改，解決了一批群眾身邊的生態環境問題。截至6月底，督察組交辦的3321件群眾舉報問題已辦結或階段辦結3091件，其中責令整改1862家；立案處罰419家，罰款2251.82萬元；立案偵查56件，拘留48人，約談194人，問責217人。督察指出，湖南省生態環境保護工作雖然取得重要進展和成效，但與預期，仍有不少差距。
一是貫徹落實生態文明思想有差距。
存在“兩高”項目上馬沖動現象，一些不符合要求的項目堅持續建。湖南省在編制省“十四五”能源發展規劃時，未落實《關于全面推動礦業綠色發展的若干意見》“全面退出石煤開發”要求，仍允許懷化發電項目采用當地石煤作為燃料，環境風險隱患較大。湘鋼集團東安石灰石礦資源綜合利用項目未進行能源評估就已開工建設。化解過剩產能不夠有力，懷化市為引進日產8000噸熟料水泥生產線，在省內熟料產能過剩的情況下，依然接受其他省外出讓熟料產能進行置換。
省級統籌謀劃不夠。湖南省對礦山生態修復、重金屬污染治理、礦涌水治理等歷史遺留問題，統籌謀劃、指導幫扶不夠；一些地方一味“等靠要”，工作標準不高，導致一些重點工作推進遲緩。郴州市魯塘礦區廢棄礦山占地560公頃，遺留生態環境問題長達十余年未開展整治；全省數十萬噸歷史遺留及每年新產生的數千噸砷堿渣未得到有效處置；一些地方礦涌水治理投資巨大，效果不佳。
二是重金屬和礦山污染問題依然突出。
湖南省部分區域及工礦場地重金屬污染嚴重，涉重尾礦庫、廢棄礦山多。部分歷史遺留涉重廢渣治理進展遲緩。
大部分在產砂石土礦存在越界開采、侵占林地、超規模開采等問題。邵陽縣長陽礦區2萬余噸廢渣侵占土地；婁底市2020年砂石土礦開采量達4304萬噸，超出“十三五”規劃要求的年開采量近1倍。懷化市溆浦縣5家硅砂開采企業附近山體植被大面積被破壞。張家界市210多家大理石、方解石采石制砂企業，多點無序開發，非法毀林占地時有發生。
全省各類廢棄礦山達6950座，大部分未落實“誰開發、誰治理”要求，生態修復率不到45%，部分修復工程浮皮潦草。懷化市547座廢棄礦山，70%未開展治理修復，大量酸性含重金屬淋溶水直排。婁底市368座廢棄礦山中超過三分之二未開展治理修復，其中79個礦洞排放強酸性廢水。部分尾礦庫環境安全隱患較為突出，湘西州49座需要開展治理或閉庫尾礦庫，僅完成閉庫10座。邵陽市應完成治理的26座尾礦庫，尚有11座未開展治理。此外，廢棄礦山生態修復機制不夠完善，后續恢復治理多由屬地政府兜底埋單。